久久精-久久经典视频-久久加久久-久久极品视频-一区二区福利视频-一区二区不卡在线观看

　　Sequencher是一款專業強大的DNA序列分析入拼接工具。通過將最新的命令行的同行評議NGS算法使臺式科學家進入一個直觀的指向和點擊界面。它是DNA序列分析的工業標準軟件。它可以和所有的自動序列分析儀一同工作，并且因為它的極速Contig組裝、很短的學習曲線、用戶友好的編輯工具以及卓越的技術支持而眾所周知。

【功能特點】

　　1、SNP 檢測

　　使用 Sequencher 來進行比較對準以便鑒別和報告 SNP 以及突變。

　　例如，調用第二峰..功能分析你的所有序列以尋找潛在的雜合子。你可以控制定義一個雜合子的嚴格度。

　　Sequencher 中國總代理

　　在裝配總攬中表示出所有雜合子的位置。

　　Sequencher 中國總代理

　　你可以從一個雜合子跳到下一個，而僅僅需要在 Base View 里面按一下空格鍵。你還可以觀察一致及其參考序列的轉換。

　　一致及其參考序列的區別會列在一個可導出的表格內。參考序列確保從一個裝配到下一個裝配時，SNP 的數目保持一致。

　　2、序列裝配

　　Sequencher 的裝配算法可以將你的 DNA 片斷快速而又準確的裝配起來。自覺的工具允許你在數秒內就可以設置好參數并且調整它們。

　　你完全可以不顧方向的裝配序列。Sequencher 會比較前端和反轉補體方向來裝配最可能的 Contig。

　　將 Sequencher 的多功能裝配工具應用到：

　　確定矢量構造

　　裝配病毒和細菌基因組

　　從 cDNA 庫中聚類數以萬計的序列

　　將基因變體和一個參考序列做對比

　　創建一個引物地圖

　　將 cDNA 裝配成基因組序列

　　以及其他許多項目...

　　Sequencher 能夠給你足夠的信心認為一個序列是絕對正確的。你可以只觀察一個序列的色譜圖，你也可以從前端或反方向同時查看多個對齊的色譜圖。 在你的已對齊數據中滾動是很容易的。你可以使用 Sequencher 的選擇工具來高亮不一致或者低質量的區域。

　　3、自動分析

　　Sequencher 可對你的數據進行批處理，這個過程是透明、用戶可定義、可恢復的，并且 Sequencher 從不為了自動化的目的而破壞你科學結論的正確性。

　　當你工作在多個序列時，Sequencher 可以：

　　調用第二峰

　　調整矢量

　　調整低質量的尾端

　　創建一致序列

　　恢復到實驗數據

　　Sequencher 總是管理兩份數據，一份編輯過的，一份則是原始的導入數據。當你應用“Revert to Experimental Data”命令到在你項目中已選定的序列或者在一序列中的選中部分時，你可以撤銷所有或者部分編輯動作。

　　自從 4.5 以后，Sequencher 就包含了一個新的自動化工具，“Assemble by Name”。依靠“Assemble by Name”，你可以選擇片段名的一部分作為一個共享的標識符，或者說是“裝配句柄”。Sequencher 就可以將選擇和名字自動轉換為 Contig。例如，僅僅通過一個按鈕的點擊，你就可以將 90 個文件，45對前端和反向序列轉換成 45 個根據你的病人編號命名的 Contig。裝配參數的每個變化都會重組你的片段，因此你可以根據克隆編號、日期、引物，或者其他任何你記錄在序列名稱中的特征，來裝配 Contig。

　　如果你做了許多排序，你會感激“Assemble by Name”，尤其是在你有許多個帶有一個標準引物集的樣本序列時。事實上，任何在序列名中具有可用信息人的人，都有可能使用“Assemble by Name”。一些應用包括：

　　用于身份鑒定和人口研究的 MHC 和線粒體基因排序。

　　候選基因的 PCR 產品的分析。

　　對保存的跨系統分類物種基因的排序。

　　通過跟蹤病毒對抗病毒劑或疫苗的抗藥性，對病毒序列進行監控。

　　即使在項目中只有一個 Contig，“Assemble by Name”仍然是有用的，因為它確保 Contig 的名稱可以精確的表述樣本的名稱。如果你有命名為“Bob”的樣本，那么正確命名你的 Contig 并不是什么難事，但但你有象“Bob-2309888762-4321”這樣更復雜的名字時，允許 Sequencher 命名你的 Contig 是非常有用的。

　　4、矢量調整

　　自動排序器以基礎調用錯誤生成結果。從 DNA 庫克隆的序列通常包括矢量序列、polyA 尾，或其他不相關序列。內含子和引物序列通常會和放大的外顯子序列側面相連。不調整的話，這些污染物會扭曲你的裝配和下游分析。 Sequencher 允許你調整低質量或者含糊的數據。“Trim Ends”將令人誤解的數據從序列片段的尾部去除。“Trim Vector”將污染序列尾部的特定序列數據移除。“Trim to Reference”剔除超出裝配參考序列的序列尾部。

　　在執行一個調整之前，Sequencher 會顯示一個計劃調整的圖形描述，這個功能甚至允許你重新定義你的條件。